Un blog sobre apuntes de Química principalmente y otros intereses que se pueden tener como universitario que estudia quimica en Santiago de Compostela. Se empezó este blog para dar respuestas a la gente a la hora de enfrentar la licenciatura. Con el sistema de grado puede que el contenido no se estructure de la misma forma
miércoles, 29 de diciembre de 2010
convocatoria erasmus 1
Voy a investigar un poco sobre las universidades de las que ofertan plaza e iros dejando las webs para que echeis un vistazo por si os animais. Yo la verdad me lo estoy pensando bastante en serio, aunque habrá que tener paciencia con todo lo que hay que presentar.
REUNIÓN INFORMATIVA
LUGAR: AULA MAGNA DA FACULTADE DE QUÍMICA
DATA: MÉRCORES, 12 DE XANEIRO
HORA: 12.00
• INFORMACIÓN:
o http://www.usc.es/gl/servizos/ore/erasmus_outgoing.html
• SOLICITUDES:
Online a través da Secretaría Virtual
• PRAZO DE SOLICITUDE:
Ata o 28 de xaneiro de 2011
sábado, 4 de diciembre de 2010
Bacterias Arsénico
http://www.nasa.gov/topics/universe/features/astrobiology_toxic_chemical.html
La realización de pruebas en el duro ambiente del lago Mono en California han descubierto el primer microorganismo conocido en la Tierra capaz de prosperar y reproducirse utilizando el arsénico
Este hallazgo de una composición bioquímica alternativa se publica en la edición de esta semana de Science Express.
El fósforo es parte de la estructura básica del ADN y ARN, las estructuras que transportan instrucciones genéticas para la vida, y se considera un elemento esencial para todas las células vivas.
El arsénico, que es químicamente similar al fósforo, es venenosa para la mayoría de la vida en la Tierra. El arsénico altera las vías metabólicas, porque químicamente se comporta de manera similar al fosfato.
El microorganismo descubierto recientemente, la cepa GFAJ-1, es un miembro de un grupo común de bacterias, el Gammaproteobacteria. En el laboratorio, los investigadores lograron hacer crecer los microorganimos del lago con una dieta muy escasa en el fósforo, pero que incluye porciones generosas de arsénico. Cuando los investigadores quitaron el fósforo y lo reemplazaron con arsénico los microorganismos siguieron creciendo. Los análisis posteriores indicaron que el arsénico era utilizado para producir los bloques de construcción de nuevas GFAJ-1 en las células.
El equipo optó por explorar el Lago Mono, debido a su composición química inusual, especialmente su alta salinidad, alcalinidad alta, y los altos niveles de arsénico. Esta química es en parte un resultado del aislamiento del lago Mono desde sus fuentes de agua dulce durante 50 años.
Estos resultados abrirán nuevas fronteras de la microbiología y otras áreas de investigación.
lunes, 25 de octubre de 2010
Ada Yonath Nobel de Química en 2009
Conseguir el Nobel es el máximo honor para un químico, retemonos a nosotros mismos a conseguirlo algún día.
Yonath es la cuarta mujer que gana un Nobel de Química en toda la historia de estos premios que entrega la Real Academia de las Ciencias de Suecia. Es, además, la segunda que no es miembro de la familia Curie y una de las dos premiadas no estadounidense. Visita la USC y creo que sería genial que todos los que puedan ir lo hagan y de algún modo demostremos que no caemos en la mediocridad de darle más valor a la gente que consigue las cosas fácilmente.Demos la importancia que tiene a la investigación dando ejemplo nosotros mismos, quizás algún día se contagie el entusiasmo por los avances que eso supone a la población en general, aqui en Galicia primero y luego al resto de España.Aunque el propio Centro donde se dará la conferencia no lo ha anunciado en su web, pero si el periódico digital de la Universidad, La voz de Galicia, el ABC.
Hoy lunes 25 ás 20:00 horas en el Centro Sociocultural Fundación Caixa Galicia,Rúa do Vilar 19, dará una conferencia titulada ‘O ribosoma: unha máquina de ARN que sobreviviu á presión da evolución, pero está paralizada polos antibióticos’.
http://xornal.usc.es/xornal/acontece/2010_10/noticia_0085.html
http://www.lavozdegalicia.es/santiago/2010/10/22/0003_8799613.htm?idioma=galego
http://www.abc.es/agencias/noticia.asp?noticia=564340
lunes, 27 de septiembre de 2010
El alfabeto griego
domingo, 28 de febrero de 2010
test 3 bioquímica I
NOMBRE Y APELLIDOS:
FIRMA:
1) La molécula cAMP es: a) 3,5-adenosín monofosfato cíclico; b) 2’,3’-adenosin monofosfato
cíclico; c) 2’, 5’-adenosín monofosfato cíclico; d) 3’-5’-adenosín monofosfato cíclico.
2) Un cap de tipo 0 tiene: a) ninguna metilación; b) una metilación; c) dos metilaciones; d) tres
metilaciones.
3) Señalar la afirmación correcta: a) los mRNAs bacterianos suelen ser monocistrónicos, b) la
síntesis de proteínas en bacterias comienza con formilmetionina; c) en eucariotas, los procesos de
transcripción y traducción están acoplados; d) el anticodón de los tRNAs está en el brazo aceptor.
4) Cual es el origen de la presencia de un surco mayor y otro menor en la doble hélice B del
DNA: a) el enfrentamiento de una base púrica a una pirimidínica; b) la unión de las bases a la
desoxirribosa en conformación anti; c) la existencia de repulsión estérica entre pares de bases
adyacentes; d) la exposición de los grupos fosfato hacia el exterior de la doble hélice.
5) Un dsDNA con alto contenido en G+C tiene: a) bajo punto de fusión; b) elevada densidad de
flotación; c) mucho efecto hipercrómico; d) valor elevado de absorbancia a 260 nm.
6) Si quieres secuenciar por el método didesoxi el siguiente fragmento de DNA:
5’ GCTGCAATGAACTGGGCATA ………………TCCGATTTAAGCCTATTA 3’, que
cebador usarías: a) 5’ CGACGTTACTTGACCCGT 3’; b) 5’ GGCTAAATTCGGATAAT 3’; c)
5’ TGCCCAGTTCATTGCAGC 3’; d) 5’ TAATAGGCTTAAATCGG 3’.
7) Un plásmido recombinante es: a) un plásmido que proviene de otra bacteria; b) un plásmido
que se originó por recombinación de dos plásmidos; c) un plásmido al que se le ha introducido un
inserto; d) un plásmido linearizado.
8) Un nucleosoma es: a) el núcleo de una célula somática; b) la asociación de un mRNA a varios
ribosomas; c) la asociación del DNA a un octámero de histonas; d) un DNA extracromosómico.
9) Un telómero es: a) un DNA viral; b) el extremo de un cromosoma; c) la parte central de un
cromosoma; d) un mRNA unido a varios ribosomas.
10) Con respecto a la síntesis en fase sólida de oligonucleótidos: a) se realiza en dirección 5’
3’; b) está catalizada por una DNA polimerasa; c) necesita la presencia de un oligonucleótido
cebador; d) ninguna de las anteriores es cierta.
11) Un intrón es: a) un ácido nucleico bacteriano extracromosómico; b) una región codificante de
un gen eucariota; c) una región no codificante de un gen eucariota; d) la secuencia de aminoácidos
de una proteína que se pierde cuando se vuelve activa.
12) ¿Qué es lo que caracteriza a un DNA de doble cadena?: a) poseer elevada densidad de
flotación; b) poseer un contenido de G+C = A+T; c) poseer un contenido de G+T = C+A; d) el
número de adeninas es igual al de citosinas.
13) Indica la respuesta correcta: a) el ciclo celular está formado por las fase G1, S, G2 y mitosis;
b) en la fase G1 la célula es 2n; c) la última fase de la mitosis es la telofase; d) las tres respuestas
anteriores son ciertas.
14) El brazo aceptor de los tRNAs contiene: a) el lugar de unión a los ribosomas; b) el lugar de
unión al mRNA; c) el lugar de unión al aminoácido; d) el triplete anticodón.
15) Señala la respuesta correcta: a) el DNA se replica por un mecanismo conservativo; b) el
DNA mitocondrial es lineal y de doble cadena; c) la síntesis de DNA en la célula se realiza en
dirección 5’ 3’; d) el DNA nuclear es circular y de doble cadena.
16) Una enzima de restricción es: a) una exonucleasa; b) una endorribonucleasa con
especificidad de secuencia; c) una endodesoxirribonucleasa sin especificidad de secuencia; d) una
endodesoxirribonucleasa con especificidad de secuencia.
17) Señala la respuesta correcta: a) el DNA tiene mayor densidad de flotación que el RNA; b) el
RNA se hidroliza en 1 M NaOH y el DNA no; c) el RNA se extrae con fenol y el DNA no; d)
ninguna de las anteriores es cierta.
18) ¿Cuál de los siguientes componentes no es necesario para una reacción de PCR?: a) 4
dNTPs; b) DNA polimerasa; c) dos oligonucleótidos cebadores; d) un ddNTP.
19) Con respecto al proceso de maduración de los mRNAs nucleares: a) todos poseen cap; b)
todos poseen cola de poli(A); c) todos sufren fragmentación o splicing; d) las tres respuestas
anteriores son ciertas.
20) Si la secuencia de un fragmento de RNA es: 5’ …CGCUAUAGC…3’, indica cual sería la
secuencia de la hebra codificadora de su gen: a) 5’…CGCTATAGC…3’; b)
5’…GCGATATCG…3’; c) 5’…GCTATAGCG…3’; d) 5’…CGATATCGC…3’.
21) Señala la respuesta falsa: a) un aminoácido se puede unir a varios tRNAs; b) un aminoácido
puede ser codificado por varios codones diferentes; c) una aminoacil-tRNA-sintetasa puede unir
varios tRNAs diferentes; d) una aminoacil-tRNA-sintetasa puede unir varios aminoácidos
diferentes.
22) Indica cual de los siguientes componentes no es necesario para clonar un gen en un
plásmido: a) una DNA polimerasa; b) enzimas de restricción; c) un plásmido con origen de
replicación; d) un plásmido con un gen de resistencia a un antibiótico.
23) Señala la vitamina liposoluble que desempeña un papel importante en la coagulación de
la sangre: a) A; b) D; c) E; d) K.
24) Indica que coenzima participa en la unión y transferencia de grupos acilo: a) FAD; b)
ácido lipoico; c) biotina; d) coenzima A.
25) El diisopropilfluorofosfato se utiliza para: a) identificar residuos de serina del centro activo;
b) para romper los enlaces disulfuro intracatenarios de la enzima; c) para identificar residuos de
cisteína del centro activo; d) para inhibir reversiblemente a ciertas enzimas.
26) La KM de una enzima: a) es una constante para una enzima independientemente de cual sea el
sustrato; b) cuanto mayor es su valor mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato; c) representa
la concentración de sustrato a la cual la velocidad de la reacción es el 50% de la velocidad máxima;
d) su valor se hace menor a medida que aumentamos la concentración de un inhibidor competitivo.
27) Un efector alostérico: a) compite con el sustrato por el centro activo de la enzima; b)
modifica covalentemente a la enzima; c) se une a un lugar de la enzima diferente del centro activo;
d) altera la proporción sustrato/producto en el equilibrio.
28) Un inhibidor reversible no competitivo: a) se une al centro activo de la enzima; b)
disminuye el valor de la VM; c) disminuye el valor de la KM; d) aumenta el valor de la KM.
29) Un valor alto de la KM de una enzima indica que: a) la enzima tiene baja afinidad por el
sustrato; b) la enzima tiene alta afinidad por el sustrato; c) la velocidad máxima es elevada; d) la
velocidad máxima se alcanza a bajas concentraciones de sustrato.
30) Una enzima alostérica se caracteriza por: a) ser monomérica; b) presentar una cinética
hiperbólica; c) presentar efecto cooperativo de unión al sustrato; d) inhibirse o activarse por
inhibidores competitivos.
31) Un zimógeno es: a) un precursor inactivo de una enzima proteolítica; b) un tipo de enzima de
restricción; c) una enzima alostérica; d) un RNA con actividad catalítica.
32) Las isoenzimas son: a) formas enzimáticas diferentes de una enzima que catalizan una misma
reacción; b) RNAs con actividad catalítica; c) enzimas que catalizan reacciones muy parecidas; d)
precursores inactivos de enzimas.
33) Se dice que el ATP es una molécula metaestable porque: a) es estable en presencia de
ATPasas; b) es estable en ausencia de enzimas; c) el estado de transición en el paso de ATP a ADP
tiene baja energía de activación; d) pasa a ser inestable cuando se une a iones metálicos.
34) Si una reacción tiene una variación de energía libre estándar negativa, quiere decir: a)
que esa reacción es termodinámicamente desfavorable; b) que es termodinámicamente favorable; c)
que la reacción transcurre de forma espontánea en condiciones fisiológicas; d) que transcurre de
forma espontánea partiendo de condiciones estándar.
test 2 de bioquímica
NOMBRE Y APELLIDOS:
FIRMA:
1. Con respecto a la estructura de los aminoácidos señalar la respuesta correcta: a) la glicina no presenta
actividad óptica; b) el grupo amino del carbono alfa de la prolina es secundario; c) la treonina tiene dos
carbonos asimétricos; d) las tres respuestas anteriores son ciertas.
2. ¿Cuál de los siguientes aminoácidos contiene un grupo hidroxilo?: a) arginina; b) triptófano; c) treonina;
d) histidina.
3. El punto isoeléctrico de un anfolito es: a) el pH al cual no está ionizado; b) el pH al cual tiene carga neta 0;
c) el punto al cual no posee actividad óptica; d) el pH al cual no tiene cargas.
4. Si los valores de los pKa de los grupos ionizables de la histidina son: pK1: 1,82; pKR: 6.00; y pK2: 9,17,
cual sería el valor de su punto isoeléctrico: a) 3,96; b) 5,49; c) 5,66; d) 7,58.
5. Dentro de una cadena polipeptídica cual de los siguientes enlaces tiene libertad de giro [-Ca(R,H)-CONH-
Ca(R,H)-] : a) el Ca(RH)-CO; b) el CO-NH; c) el C=O; d) los tres citados tienen libertad de giro.
6. Cual de las siguientes parejas de reactivos utilizó Anfinsen para desnaturalizar y estirar
completamente la cadena polipeptídica de la ribonucleasa: a) reactivo de Sanger y SDS; b) betamercatptoetanol
y urea; c) SDS y urea; d) iodoacetato y beta-mercaptoetanol.
7. El poliglutámico debería adoptar conformación de hélice-alfa a: a) pH 7; b) pH 13; c) pH 3; d) no adopta
la conformación de hélice alfa a ningún pH.
8. Que reactivo deberías utilizar para identificar el residuo aminoterminal de una proteína: a) ninhidrina;
b) dinitrofluorobenceno; c) hidracina; d) DTT.
9. Cuál es el residuo aminoacídico más abundante en el colágeno: a) lisina; b) glicina; c) prolina; d) valina.
10.La conclusión principal del experimento realizado por Anfinsen sobre la
desnaturalización/renaturalización de la ribonucleasa fue que: a) las proteínas se renaturalizan de forma
espontánea si no se rompen sus enlaces disulfuro; b) las proteínas desnaturalizadas precipitan; c) la
información necesaria para el plegamiento de una proteína está contenida en su secuencia aminoacídica; d) es
necesaria la asistencia de proteínas auxiliares para que una proteína pueda plegarse correctamente.
11.Que cargas que tendría el péptido Pro-Glu-Lys-Ala-Asn-Ser-Asp-Ser a pHs 1; 7; y 13: a) +2, -1, -3; b)
+2, 0, -1; c) +3, -1, -2; d) +2, +2, 0.
Un polipéptido se cortó con tripsina (corta después de Lys, K y Arg, R) y con bromuro de cianógeno
(corta después de Met, M) y los péptidos resultantes se aislaron y secuenciaron:
Péptidos trípticos: Péptidos con bromuro de cianógeno:
T1: DAGYHDFEPIDPR C1: ALIKYLIACGPM
T2: GASMALIK C2: TKDCVHSD
T3: YLIACGPMTK C3: DAGYHDFEPIDPRGASM
T4: DCVHSD
12.Que péptido contiene el residuo C-terminal del polipéptido: a) T4; b) T2; c) C1; d) C3.
13.Que péptido contiene el residuo N-terminal del polipéptido: a) T4; b) T2; c) C1; d) C3.
14.Que técnica deberías usar para separar los aminoácidos de una mezcla: a) electroforesis
desnaturalizante; b) ultracentrifugación; c) cromatografía de intercambio iónico; d) ultrafiltración.
15.Señala la respuesta correcta: a) el primer residuo que se incorpora en la síntesis en fase sólida de péptidos
es el N-terminal; b) el enlace peptídico es planar; c) la Lys rompe la conformación de hélice-a; d) el primer
residuo que se incorpora en la síntesis ribosomal de proteínas es el C-terminal;.
16.¿Qué modificación proteica impide normalmente la secuenciación automática de una proteína
eucariota a través de su extremo amino?: a) fosforilación; b) glicosilación; c) acetilación; d) metilación.
17.¿Qué modificación covalente tiene una mayor influencia sobre el punto isoeléctrico de una proteína?:
a) fosforilación; b) glicosilación; c) acetilación; d) hidroxilación.
18.Con respecto a la conformación de hélice-a, señala la respuesta correcta: a) se altera por la presencia de
residuos de Lys; b) se encuentra en todas las proteínas globulares y en algunas fibrosas; c) se estabiliza por
enlaces de hidrógeno intracatenarios; d) se estabiliza fundamentalmente por enlaces de hidrógeno
intercatenarios.
19.A la hélice a se la denomina hélice 3,613: a) el número 13 indica el número de átomos de la cadena
polipeptídica que separan un enlace por puente de hidrógeno; b) el número 13 indica la distancia en
amstrongs que avanza una vuelta de hélice a lo largo del eje; c) el número 3,6 indica la distancia en
amstrongs que avanza cada residuo en la cadena polipeptídica; d) el número 3,6 indica el diámetro en
amstrongs de la hélice a.
20.
21.La precipitación salina o “salting out”: a) se suele realizar incrementando progresivamente la
concentración de sales monovalentes; b) se suele realizar a diferentes pHs para incrementar su especificidad;
c) desnaturaliza a las proteínas, y como consecuencia precipitan; d) induce un aumento de las interacciones
proteína-proteína causando su precipitación.
22.Indicar cual de las siguientes afirmaciones es falsa: a) el sulfato amónico se utiliza regularmente para
precipitar proteínas; b) el detergente iónico SDS se une a las proteínas mediante atracciónes electrostáticas; c)
las albúminas son más solubles en agua que las globulinas; d) las histonas son proteínas que presentan puntos
isoeléctricos bajos.
23.Para separar dos proteinas de puntos isoeléctricos similares pero de tamaños muy diferentes, usarías:
a) cromatografía de intercambio iónico; b) centrifugación diferencial; c) cromatografía de exclusión
molecular; d) liofilización.
24.Para desalar una disolución proteica, usarías: a) liofilización; b) cromatografía de intercambio iónico; c)
diálisis; d) electroforesis.
25.Para desproteinizar una disolución que contiene ácidos nucleicos y proteínas, usarías: a) ultrafiltración;
b) extracción con fenol; c) cromatografía; d) el reactivo de Edman.
26.La velocidad de migración de una proteína globular en un gel desnaturalizante de poliacrilamida va a
depender de: a) la relación masa/carga de la proteína; b) exclusivamente de su carga; c) exclusivamente de
su masa, d) del pH al que se realice la electroforesis.
27.La diálisis se puede utilizar para: a) desalar una disolución proteíca; b) eliminar los aminoácidos que están
mezclados con proteínas; c) cambiar el tampón de una disolución proteica; d) las tres respuestas anteriores
son correctas.
28.La secuencia PRE- de una proteína es: a) la secuencia señal; b) la secuencia que se pierde al salir la
proteína de la célula; c) la secuencia que precede a la parte activa de la proteína; d) la secuencia del extremo
carboxilo que se pierde cuando la proteína penetra en el retículo endoplamático.
29.Que partículas lipoproteicas transportan triglicéridos desde el intestino hasta los tejidos: a)
quilomicrones; b) VLDL; c) LDL; d) HDL.
30.¿Qué factor juega un papel fundamental en la transferencia de oxígeno de la madre al feto?: a) la
concentración de protones; b) la concentración de CO2; c) la concentración de 2,3-bisfosfoglicerato; d) la
concentración de bicarbonato.
31.El efecto Bohr dice que la afinidad de la hemoglobina por el oxígeno se reduce por: a) aumento de la
concentración de CO2; b) reducción del pH; c) aumento en la concentración de 2,3-bisfosfoglicerato; d)
reducción de la presión parcial de oxígeno.
32.Que es una quinasa: a) una enzima proteolítica; b) una enzima que cataliza la fosforilación de proteínas; c)
una enzima que cataliza la desfosforilación de fosfoproteínas; d) un precursor inactivo de una enzima.
33.Con respecto a la glicosilación de proteínas, señala la respuesta correcta: a) las proteínas citosólicas
suelen estar glicosiladas; b) en las glicoproteínas N-glicosiladas el carbohidrato está unido al grupo amino de
la cadena de un residuo de lisina; c) en las glicoproteínas O-glicosiladas el carbohidrato está unido al grupo
hidoxilo de la cadena de un residuo de tirosina; d) ninguna de las tres repuestas anteriores es cierta.
34.Con respecto al uso de isótopos radiactivos, señala la respuesta correcta: a) un emisor beta emite
partículas con una energía fija; b) un contador de centelleo no detecta emisores beta de baja energía, como el
tritio; c) un contador de centelleo permite contar las emisiones de varios emisores beta de diferente energía en
la misma muestra; d) mediante la autorradiografía se pueden detectar emisores beta de baja energía, como el
tritio.